塔利布在阿拉伯语中是学生的意思，在普什图语等伊朗语族语言中的复数形式即为塔利班。它的大部分成员是来自阿富汗东部和南部普什图人地区的的伊斯兰教宗教学生。他们曾经在巴基斯坦伊斯兰学校就读，故又称伊斯兰学生军。
塔利班游击队1994年9月，穆罕默德·奥马尔在他的家乡坎大哈与50名学生一起创立了塔利班。亲苏政府被推翻后，奥马尔对伊斯兰教法没有在阿富汗实施感到不满，于是他组建塔利班并下定决心要推翻阿富汗军阀，在阿富汗全国实施伊斯兰教法。塔利班成立的几个月内，来自巴基斯坦宗教学校的15000名阿富汗难民学生加入了塔利班。
1990年代末取得政权1995年5月与6月间，塔利班发动了代号为进军喀布尔的战役，很快地控制了阿富汗近40%的地区。塔利班乘胜向喀布尔发起全面攻击。在同年9月26日，占领了电台、和总统府。此时，塔利班已经全面控制了首都，之后还控制了包括首都喀布尔在内的全国90%以上的领土，而反塔利班联盟中唯一具有与塔利班正面对抗能力的，只剩下马苏德一派。掌权后，塔利班将前社会主义政权领导人纳吉布拉从联合国驻喀布尔办事处中带出处死，并将尸体吊在卡车上示众。塔利班声称要建立世界上最纯洁的伊斯兰国家，但执政以来对国家重建并无明显建树，主要原因在于经济每况愈下，加上疾病流行，使它得到的支持度逐渐下降。1996年至2001年间，塔利班在阿富汗建立全国政权，正式名称为阿富汗伊斯兰酋长国。由于它在阿富汗实施独裁专制和政教合一政策，因此仅被巴基斯坦、阿拉伯联合酋长国和沙特阿拉伯三个国家承认是代表阿富汗的合法政府。它曾经多次不顾联合国的要求，为奥萨玛·本拉登提供庇护。
2001年，塔利班政权不理会联合国教科文组织及外国非政府组织的反对，颁令称巴米扬大佛雕像是崇拜偶像的行为，以炸药及坦克炮火摧毁这座古迹。在破坏行动期间，塔利班的信息部长昆德拉图拉赫·贾马尔叹道：“破坏工作并非如人们所想般容易，你不能以炮轰推倒那些佛像，因为它们是凿入山崖内；它们牢牢地连接山岭。”2001年3月，两尊大佛在经过近一个月的猛烈炮轰后，最终被炸药摧毁。
911事件后至政权丧失2001年9月11日，美国多地发生恐怖袭击事件，史称911事件。这一系列的恐怖袭击事件震惊了全世界，后经过调查得出结论，该系列事件为奥萨马·本拉登领导的基地组织所为，由于塔利班庇护奥萨马·本拉登领导的基地组织及支持圣战，他们被美国及其盟国短暂地定义为恐怖份子，美国要求塔利班政权引渡本·拉登，但遭到拒绝。同年北约与北方联盟一起发动了阿富汗战争，将塔利班政权推翻。塔利班领导人奥马尔逃入山中，并继续领导塔利班与美军对抗。塔利班多次以奥马尔的名义发表声明。在2004年的一次* 采访中，奥马尔声称塔利班武装将会“像猎杀猪一样猎杀美军”。2006年伊拉克统一圣战组织阿布·穆萨布·扎卡维被美军炸死，奥马尔对其表示敬意，称赞他是殉道者，声称在阿富汗和伊拉克的抵抗运动不会被削弱。塔利班敌视美国，与基地组织联手对抗美军，但奥马尔希望阿富汗和平，一直试图与阿富汗政府展开和谈。2007年，一部分人创立了巴基斯坦塔利班，企图推翻巴基斯坦的统治。其部落领地与分支分散在全国各地。
游击战然而塔利班组织没有因此销声匿迹，其成员继续以绑架人质或发动恐怖攻击的方式对抗阿富汗现政府、美国及支持美国的其他国家，如2007年塔利班挟持韩国人质事件。2007年7月19日，23名韩国人质被塔利班绑架。塔利班要求释放关押在阿富汗监狱中的所有塔利班成员，并要求韩国军队撤出阿富汗。7月25日，塔利班处死1名男性韩国人质。30日，塔利班再次杀死1名人质。8月13日塔利班释放两名女人质。28日塔利班同意释放剩余韩国人质。至此塔利班武装分子绑架的23名韩国人质，除2名被杀害外，21名人质全部获释，长达42天的人质危机也终告结束。
自奥萨马·本·拉登被击毙后，塔利班于2014年分裂成自由联盟、卫士与马赫穆德三大派系。主要分布在阿富汗与巴基斯坦山区进行游击活动。2015年1月29日，约旦是否应与伊斯兰国交换人质引发争议，而半年前美国曾用5名塔利班囚犯交换一名美军士兵。白宫发言人连续两日受到记者两相对比的追问，于是称伊斯兰国是恐怖组织，而塔利班则是武装暴乱。同年4月，塔利班指责极端组织伊斯兰国的一系列行为违反了伊斯兰教法，并以奥马尔的名义将其定为非法组织。与此同时，伊斯兰国势力不断向阿富汗境内渗透，与塔利班发生武装冲突。
2015年7月29日，阿富汗政府宣布塔利班领导人毛拉·穆罕默德·奥马尔已于2013年4月在巴基斯坦境内病逝。翌日，奥马尔逝世的消息得到塔利班的证实，但并未公布逝世的具体时间，并宣称其在阿富汗境内逝世，与阿富汗政府公布的消息多有出入，事后塔利班推举阿赫塔尔·穆罕默德·曼苏尔为新任最高领导人。
2018年2月，阿富汗总统阿什拉夫·加尼·艾哈迈德扎伊宣布承认塔利班是合法政治团体。同年6月7日，阿富汗政府宣布将对塔利班实行为期一周的停火。同年6月9日，塔利班宣布与阿富汗政府军进行为期3天的停火，这是自2001年阿富汗战争来，塔利班首次宣布停火。
2019年1月21日，塔利班袭击阿富汗中部瓦尔达克省一处属于“国家安全总局”的军事设施，据闻死亡人数超过百人，将为近17年来对阿富汗情报机构最大打击之一。同年5月3日，阿富汗总统阿什拉夫·加尼·艾哈迈德扎伊宣布释放175名塔利班囚犯，并呼吁塔利班放弃战斗，加入阿富汗和平进程。
塔利班于阿富汗经过十几年的反扑战斗加上农村地区支持，充分利用阿富汗地形特征和宗教动员，2017年后逐步反攻占近一半领土亦有消息指实际面积更大，美国扶植的新政府军慢慢转守势。2018在联合国召开的援助阿富汗议会期间，塔利班再一次发动了炸弹袭击，导致56名阿富汗士兵死亡300多人受伤。这是一种宣告，向世人证明塔利班大型兵力还存在且敢于直接向西方公然进攻无所畏惧。美军向塔利班提出六个月的停火协议也遭到了拒绝，这已经是塔利班第三次拒绝美军的停火要求。
同时持续不断的游击战埋伏袭击政府车队，例如2018年11月25日阿富汗西部法拉省，整支警察车队被伏击战大举消灭。此类事件层出不穷，塔利班武装企图使用游击战术由点连接成面，对当地安全部队和政府官员进行近乎每天一次的袭击，最后上升为战略态势，吸引越来越多穆斯林加入其和美国基督教的圣战。其在卡塔尔建立了办事处并称为是流亡政府所在，小国卡塔尔意图在回教世界所有相关事务中扮演协调方角色，所以与塔利班有部分默契存在。
根据阿富汗重建特别监察长的报告，截至2018年1月31日塔利班已经占据59个县（占总数约14.5%），另有119个县（29.2%）陷于双方争夺中，塔利班同时继续向城市地区制造爆炸案和游击进攻。2019年4月30日美军宣布日后不再公布双方领土人口对比，更是引发一轮质疑是否是数据逆转所以不敢再公布。早在2017年8月英国BBC一项自主调查发现塔利班在70%领土上可以非常活跃的活动，基本视美军如无物也无人可奈何，而这些地区人口已近全国一半，而同年8月北约却公布塔利班只在44%领土活动，两者相差巨大在2017年就已经引起BBC关注。同时他们调查发现伊斯兰国开始出现在10%的领土上，似乎与塔利班有共存关系。
和谈塔利班与阿富汗政府曾多次进行秘密谈判。2015年7月7日，阿富汗政府和塔利班代表在巴基斯坦首都伊斯兰马巴德附近举行和谈，这是阿富汗政府与塔利班之间的首次官方和谈。
美国总统唐纳德·特朗普上台后谈判进度加快，2019年8月3日，塔利班在卡塔尔的政治总部发言人夏亨表示将与美国开始一场正式谈判。美国总统特朗普同日在白宫告诉记者：“我们已取得很大进展。我们正在谈”。2019年9月初，中东半岛电视台消息称美塔达成一个11点原则的谈判框架。美国总统特朗普也原本于9月8日与塔利班领导人进行秘密和谈，但因塔利班稍早前在喀布尔的袭击导致美国军人死亡，特朗普宣布取消与塔利班领导人谈判。
2020年2月22日凌晨起，美国、阿富汗政府和塔利班开始为期一周的“减暴”协议。“减暴”期间，塔利班将不对城市、公路、美军基地和阿安全部队袭击。阿安全部队和北约驻阿联军也不会对塔利班展开军事行动。
2020年2月29日，美国与阿富汗塔利班签署协议，协议规定驻阿美军将逐步撤军，阿富汗塔利班则保证打击恐怖组织基地组织、伊斯兰国，并与喀布尔政府进行和平谈判。但由于阿富汗总统拒绝释放塔利班囚犯，塔利班与阿富汗政府再次爆发冲突。仅仅在3月4日，塔利班又杀死至少20名阿富汗士兵和警察。塔利班在阿富汗34个省当中的15个省发动30次袭击，共杀死35名阿富汗安全部队士兵。随后塔利班遭到美军空袭。4月20日，塔利班又杀死至少23名阿富汗军警及9名平民。
2020年9月12日，阿富汗政府与塔利班在卡塔尔进行谈判。但阿富汗产生伤亡的暴力事件依旧持续。阿富汗政府希望双方达成政治安排之前塔利班率先停火，但塔利班拒绝接受。
拜登就任美国总统后，宣布美军将于2021年5月1日开始撤军，截至2021年9月11日前美军将全部撤出阿富汗，多个北约国家也表示将从阿富汗撤军。2021年7月2日，美军将巴格拉姆空军基地移交至阿富汗军方接管、白宫新闻秘书普萨基表示驻阿美军预计于8月底前完全撤出。自2021年5月起，一方面美国等外国军队开始撤离阿富汗；另一方面，阿富汗塔利班则在阿富汗全国各地发动若干次重大攻势扩张其势力版图，喀布尔政权陷入严重危机。
政府盟军撤军至重返执政2021年5月起，伴随着美国等国家的撤军行动，阿富汗塔利班在阿富汗全国各地发动若干次重大攻势以扩张其势力版图。同7月7日，塔利班发言人苏海尔·沙欣受访表示，塔利班目前控制阿富汗85%的土地，8月8日，北方大城昆都士被占领。8月12日，塔利班攻占阿富汗第二大城坎大哈、第三大城赫拉特，以及西南部各省份。8月14日，北方第一大城马扎里沙里夫也被塔利班占领。8月15日，塔利班军队已进入首都喀布尔总统府，总统阿什拉夫·加尼已流亡阿联酋，政府代表宣布总统辞职并向塔利班和平移交政权，神学士于20年后重新掌权阿富汗。塔利班再次夺取政权后。
